Ο δεύτερος θολωτός τάφος της Τραγάνας, ήταν κτισμένος σε μικρή απόσταση από τον πρώτο θολωτό τάφο και χρησιμοποιήθηκε από τον 16ο αιώνα μέχρι τις αρχές του 13ου αιώνα π.Χ. Στο εσωτερικό του θαλάμου βρέθηκαν ταφικοί λάκκοι, ένας εκ των οποίων περιείχε τις καύσεις δύο μικρών κοριτσιών 14-16 ετών με ιδιαίτερα κτερίσματα, όπως κοσμήματα και σφραγιδόλιθους. Περισσότερα από χίλια χρόνια αργότερα, κατά την ελληνιστική περίοδο, φαίνεται ότι ο τάφος επαναχρησιμοποιήθηκε ως κατοικία, καθώς εντός του βρέθηκαν μία κτιστή εστία, οικιακά και αποθηκευτικά αγγεία.